Um estudo interno do Ministério da Educação (MEC) mostrou aumento no custo anual por aluno nas Universidades Federais. Das 63 universidades federais do País, a UFMS apresenta o 21º maior custo por aluno e a UFGD está na 40º colocação. A média brasileira é de R$ 37,5 mil anual por aluno.  

Na Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, o custo por aluno, em 2016, ficou em R$ 39,2 mil por ano. Em 2009, o valor por aluno era de R$ 35,9 mil. A UFMS possui 15 mil alunos nos campi espalhados pelo Estado e possui orçamento de R$ 713 milhões.

Na Universidade Federal da Grande Dourados, atualmente com 8 mil alunos, o custo por aluno é de R$ 26,5 mil. Em 2009, esse valor era de 25,4 mil. O orçamento anual é de R$ 215 milhões.   

A folha de pagamento dos funcionários inativos da UFMS corresponde a 42,3% dos ativos. As despesas obrigatórias correspondem 88% do orçamento. Na UFGD, o pagamento dos servidores inativos corresponde  5.9% dos ativos e 90% do orçamento são gastos com despesas obrigatórias.

Despesas obrigatórias são aquelas ligadas a pessoal, inclui remuneração de ativos e inativos, contribuição da União ao Plano de Seguridade do Servidor, benefícios a servidores, residência médica e precatórios.

O relatório com os gastos de todas as universidades foi publicado pelo jornal O Estadão.